Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C1orf61Q13536 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms