Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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FOXE3Q13461 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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FOXE3Q13461 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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FOXE3Q13461 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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FOXE3Q13461 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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FOXE3Q13461 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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FOXE3Q13461 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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FOXE3Q13461 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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FOXE3Q13461 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
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FOXE3Q13461 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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FOXE3Q13461 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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FOXE3Q13461 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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