Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
XRCC4Q13426 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XRCC4Q13426 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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