Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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SCGB2A2Q13296 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
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SCGB2A2Q13296 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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SCGB2A2Q13296 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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SCGB2A2Q13296 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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SCGB2A2Q13296 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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SCGB2A2Q13296 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SCGB2A2Q13296 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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