Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP7AQ04656 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms