Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms