Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BEX3Q00994 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BEX3Q00994 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BEX3Q00994 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms