Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 KDM6A-214ENST00000621147 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX1P83916 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX1P83916 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX1P83916 NPR2-201ENST00000342694 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX1P83916 KCNMA1-208ENST00000372440 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX1P83916 KCNMA1-227ENST00000638203 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX1P83916 KCNMA1-233ENST00000638351 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX1P83916 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX1P83916 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX1P83916 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX1P83916 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX1P83916 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX1P83916 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX1P83916 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX1P83916 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX1P83916 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX1P83916 IP6K1-202ENST00000395238 4117 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX1P83916 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CBX1P83916 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX1P83916 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX1P83916 CTNNB1-201ENST00000349496 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX1P83916 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX1P83916 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX1P83916 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX1P83916 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX1P83916 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX1P83916 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX1P83916 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX1P83916 KIF25-AS1-202ENST00000456585 2795 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX1P83916 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX1P83916 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX1P83916 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX1P83916 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX1P83916 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX1P83916 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX1P83916 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX1P83916 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX1P83916 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX1P83916 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX1P83916 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX1P83916 RNFT2-201ENST00000257575 3882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX1P83916 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX1P83916 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX1P83916 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX1P83916 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX1P83916 MATR3-227ENST00000618441 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX1P83916 WDR47-204ENST00000369965 4240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX1P83916 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX1P83916 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX1P83916 IP6K3-201ENST00000293756 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX1P83916 AC048382.5-201ENST00000618330 3667 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX1P83916 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX1P83916 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX1P83916 CTRC-201ENST00000375943 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX1P83916 ITIH5-201ENST00000397145 3132 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CBX1P83916 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX1P83916 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX1P83916 AC019205.2-203ENST00000421315 3362 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX1P83916 PNPLA8-206ENST00000436062 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX1P83916 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX1P83916 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX1P83916 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX1P83916 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX1P83916 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX1P83916 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX1P83916 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX1P83916 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX1P83916 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX1P83916 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX1P83916 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX1P83916 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX1P83916 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX1P83916 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX1P83916 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX1P83916 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX1P83916 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX1P83916 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX1P83916 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX1P83916 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX1P83916 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX1P83916 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX1P83916 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX1P83916 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX1P83916 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX1P83916 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX1P83916 SLC45A2-202ENST00000382102 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX1P83916 SCARA5-202ENST00000380385 2934 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX1P83916 PLOD2-209ENST00000494950 2908 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX1P83916 NOP2-212ENST00000541778 3038 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX1P83916 ATXN10-201ENST00000252934 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX1P83916 OSBPL2-203ENST00000439951 3886 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX1P83916 NAPB-207ENST00000617876 3883 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX1P83916 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX1P83916 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX1P83916 AC092028.1-202ENST00000641483 3547 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX1P83916 AC092028.1-201ENST00000641781 3540 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX1P83916 AC087164.2-201ENST00000624514 3130 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX1P83916 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX1P83916 WDR92-201ENST00000295121 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX1P83916 AL357140.3-201ENST00000639753 1983 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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