Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 CNTNAP2-201ENST00000361727 9896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 POC1B-GALNT4-202ENST00000548729 5436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 KCNAB2-202ENST00000341524 4207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 KCNAB2-206ENST00000378097 4201 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 PIK3AP1-201ENST00000339364 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
HERVK_113P61574 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 ZMIZ1-202ENST00000446377 6686 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 CCDC14-220ENST00000488653 4156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 ATP2B2-202ENST00000360273 8962 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 CACNA1G-204ENST00000359106 7648 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 COL12A1-202ENST00000345356 5886 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 CARD14-209ENST00000573882 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 DOCK4-204ENST00000428084 7997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 AC055713.1-201ENST00000498967 8279 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 ZCCHC9-201ENST00000254037 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 CSPG4P12-201ENST00000558282 4853 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HERVK_113P61574 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms