Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BRCA2P51587 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 AC006986.1-201ENST00000612764 241 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 BX088651.3-201ENST00000418155 352 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 CBR3-AS1-206ENST00000608632 659 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 SLC25A15P1-201ENST00000456738 342 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BRCA2P51587 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms