Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF6P49848 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF6P49848 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF6P49848 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF6P49848 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF6P49848 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF6P49848 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF6P49848 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF6P49848 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF6P49848 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF6P49848 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF6P49848 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF6P49848 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF6P49848 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF6P49848 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF6P49848 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF6P49848 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF6P49848 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF6P49848 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF6P49848 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF6P49848 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF6P49848 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF6P49848 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF6P49848 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF6P49848 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF6P49848 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF6P49848 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF6P49848 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF6P49848 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF6P49848 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF6P49848 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF6P49848 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF6P49848 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF6P49848 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF6P49848 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF6P49848 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TAF6P49848 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TAF6P49848 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TAF6P49848 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TAF6P49848 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TAF6P49848 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TAF6P49848 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TAF6P49848 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TAF6P49848 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TAF6P49848 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF6P49848 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF6P49848 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF6P49848 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF6P49848 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF6P49848 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF6P49848 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF6P49848 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF6P49848 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF6P49848 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF6P49848 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF6P49848 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF6P49848 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF6P49848 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF6P49848 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF6P49848 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF6P49848 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF6P49848 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF6P49848 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF6P49848 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF6P49848 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF6P49848 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF6P49848 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF6P49848 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF6P49848 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF6P49848 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF6P49848 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF6P49848 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF6P49848 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF6P49848 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF6P49848 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF6P49848 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TAF6P49848 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF6P49848 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF6P49848 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF6P49848 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF6P49848 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF6P49848 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF6P49848 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF6P49848 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF6P49848 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF6P49848 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF6P49848 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF6P49848 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF6P49848 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF6P49848 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF6P49848 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF6P49848 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF6P49848 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF6P49848 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF6P49848 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF6P49848 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF6P49848 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF6P49848 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF6P49848 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TAF6P49848 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms