Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTAP49354 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTAP49354 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTAP49354 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTAP49354 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTAP49354 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTAP49354 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTAP49354 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTAP49354 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTAP49354 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTAP49354 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTAP49354 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTAP49354 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNTAP49354 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTAP49354 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTAP49354 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTAP49354 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTAP49354 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTAP49354 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTAP49354 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTAP49354 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTAP49354 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTAP49354 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTAP49354 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTAP49354 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTAP49354 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTAP49354 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTAP49354 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTAP49354 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTAP49354 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTAP49354 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTAP49354 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTAP49354 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTAP49354 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTAP49354 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTAP49354 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTAP49354 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTAP49354 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTAP49354 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTAP49354 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTAP49354 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTAP49354 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTAP49354 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTAP49354 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTAP49354 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTAP49354 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTAP49354 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTAP49354 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTAP49354 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTAP49354 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTAP49354 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTAP49354 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTAP49354 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTAP49354 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTAP49354 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTAP49354 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTAP49354 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTAP49354 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTAP49354 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTAP49354 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTAP49354 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNTAP49354 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTAP49354 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTAP49354 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTAP49354 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTAP49354 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTAP49354 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTAP49354 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTAP49354 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTAP49354 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTAP49354 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTAP49354 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTAP49354 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTAP49354 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTAP49354 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTAP49354 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTAP49354 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTAP49354 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTAP49354 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTAP49354 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTAP49354 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTAP49354 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTAP49354 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTAP49354 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTAP49354 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTAP49354 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTAP49354 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTAP49354 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTAP49354 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTAP49354 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTAP49354 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTAP49354 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTAP49354 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTAP49354 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTAP49354 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTAP49354 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FNTAP49354 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FNTAP49354 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FNTAP49354 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FNTAP49354 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms