Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRXP46100 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRXP46100 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRXP46100 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATRXP46100 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 SNRPCP15-201ENST00000424055 192 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 RN7SL340P-201ENST00000470792 296 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 AL627095.1-201ENST00000414775 321 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 AC122694.1-201ENST00000510987 563 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ATRXP46100 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRXP46100 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRXP46100 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRXP46100 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRXP46100 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRXP46100 LINC01823-204ENST00000438722 794 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRXP46100 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRXP46100 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRXP46100 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRXP46100 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRXP46100 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRXP46100 AC091588.3-201ENST00000583442 770 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRXP46100 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRXP46100 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRXP46100 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRXP46100 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRXP46100 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRXP46100 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRXP46100 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRXP46100 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRXP46100 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRXP46100 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRXP46100 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRXP46100 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRXP46100 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRXP46100 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRXP46100 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRXP46100 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRXP46100 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRXP46100 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRXP46100 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRXP46100 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRXP46100 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ATRXP46100 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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