Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms