Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms