Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPD1P17405 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms