Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVV-2B6SEH9 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms