Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
MAP3K4Q9Y6R4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
MAP3K4Q9Y6R4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
MAP3K4Q9Y6R4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
MAP3K4Q9Y6R4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
MAP3K4Q9Y6R4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
MAP3K4Q9Y6R4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
MAP3K4Q9Y6R4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
MAP3K4Q9Y6R4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
MAP3K4Q9Y6R4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
MAP3K4Q9Y6R4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
MAP3K4Q9Y6R4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
MAP3K4Q9Y6R4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
MAP3K4Q9Y6R4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
MAP3K4Q9Y6R4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
MAP3K4Q9Y6R4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
MAP3K4Q9Y6R4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
MAP3K4Q9Y6R4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
MAP3K4Q9Y6R4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
MAP3K4Q9Y6R4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
MAP3K4Q9Y6R4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
MAP3K4Q9Y6R4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC35.58■■■■□ 3.29
MAP3K4Q9Y6R4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
MAP3K4Q9Y6R4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
MAP3K4Q9Y6R4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC35.57■■■■□ 3.29
MAP3K4Q9Y6R4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
MAP3K4Q9Y6R4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
MAP3K4Q9Y6R4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
MAP3K4Q9Y6R4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
MAP3K4Q9Y6R4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
MAP3K4Q9Y6R4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
MAP3K4Q9Y6R4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
MAP3K4Q9Y6R4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
MAP3K4Q9Y6R4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
MAP3K4Q9Y6R4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.55■■■■□ 3.28
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
MAP3K4Q9Y6R4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
MAP3K4Q9Y6R4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
MAP3K4Q9Y6R4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC35.55■■■■□ 3.28
MAP3K4Q9Y6R4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
MAP3K4Q9Y6R4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
MAP3K4Q9Y6R4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC35.54■■■■□ 3.28
MAP3K4Q9Y6R4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
MAP3K4Q9Y6R4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
MAP3K4Q9Y6R4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
MAP3K4Q9Y6R4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
MAP3K4Q9Y6R4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
MAP3K4Q9Y6R4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
MAP3K4Q9Y6R4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
MAP3K4Q9Y6R4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
MAP3K4Q9Y6R4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
MAP3K4Q9Y6R4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC35.52■■■■□ 3.28
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
MAP3K4Q9Y6R4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
MAP3K4Q9Y6R4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
MAP3K4Q9Y6R4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
MAP3K4Q9Y6R4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
MAP3K4Q9Y6R4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC35.51■■■■□ 3.28
MAP3K4Q9Y6R4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
MAP3K4Q9Y6R4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
MAP3K4Q9Y6R4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
MAP3K4Q9Y6R4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
MAP3K4Q9Y6R4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
MAP3K4Q9Y6R4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
MAP3K4Q9Y6R4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
MAP3K4Q9Y6R4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
MAP3K4Q9Y6R4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
MAP3K4Q9Y6R4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
MAP3K4Q9Y6R4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
MAP3K4Q9Y6R4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
MAP3K4Q9Y6R4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
MAP3K4Q9Y6R4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
MAP3K4Q9Y6R4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
MAP3K4Q9Y6R4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
MAP3K4Q9Y6R4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
MAP3K4Q9Y6R4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
MAP3K4Q9Y6R4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
MAP3K4Q9Y6R4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
MAP3K4Q9Y6R4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
MAP3K4Q9Y6R4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
MAP3K4Q9Y6R4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC35.48■■■■□ 3.27
MAP3K4Q9Y6R4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
MAP3K4Q9Y6R4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
MAP3K4Q9Y6R4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
MAP3K4Q9Y6R4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
MAP3K4Q9Y6R4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
MAP3K4Q9Y6R4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
MAP3K4Q9Y6R4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC35.47■■■■□ 3.27
MAP3K4Q9Y6R4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
MAP3K4Q9Y6R4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
MAP3K4Q9Y6R4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
MAP3K4Q9Y6R4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
MAP3K4Q9Y6R4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
MAP3K4Q9Y6R4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
MAP3K4Q9Y6R4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
MAP3K4Q9Y6R4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
MAP3K4Q9Y6R4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
MAP3K4Q9Y6R4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms