Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B0

CTDP1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1Q9Y5B0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTDP1Q9Y5B0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTDP1Q9Y5B0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTDP1Q9Y5B0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTDP1Q9Y5B0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CTDP1Q9Y5B0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTDP1Q9Y5B0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTDP1Q9Y5B0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTDP1Q9Y5B0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTDP1Q9Y5B0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTDP1Q9Y5B0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTDP1Q9Y5B0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTDP1Q9Y5B0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CTDP1Q9Y5B0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CTDP1Q9Y5B0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTDP1Q9Y5B0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTDP1Q9Y5B0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTDP1Q9Y5B0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTDP1Q9Y5B0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTDP1Q9Y5B0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTDP1Q9Y5B0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTDP1Q9Y5B0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTDP1Q9Y5B0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTDP1Q9Y5B0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTDP1Q9Y5B0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTDP1Q9Y5B0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTDP1Q9Y5B0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CTDP1Q9Y5B0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CTDP1Q9Y5B0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CTDP1Q9Y5B0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CTDP1Q9Y5B0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CTDP1Q9Y5B0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CTDP1Q9Y5B0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTDP1Q9Y5B0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTDP1Q9Y5B0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTDP1Q9Y5B0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTDP1Q9Y5B0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTDP1Q9Y5B0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTDP1Q9Y5B0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTDP1Q9Y5B0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTDP1Q9Y5B0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTDP1Q9Y5B0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTDP1Q9Y5B0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTDP1Q9Y5B0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CTDP1Q9Y5B0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTDP1Q9Y5B0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTDP1Q9Y5B0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTDP1Q9Y5B0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CTDP1Q9Y5B0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTDP1Q9Y5B0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTDP1Q9Y5B0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTDP1Q9Y5B0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTDP1Q9Y5B0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTDP1Q9Y5B0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTDP1Q9Y5B0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTDP1Q9Y5B0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTDP1Q9Y5B0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTDP1Q9Y5B0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTDP1Q9Y5B0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTDP1Q9Y5B0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTDP1Q9Y5B0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTDP1Q9Y5B0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTDP1Q9Y5B0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTDP1Q9Y5B0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTDP1Q9Y5B0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTDP1Q9Y5B0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CTDP1Q9Y5B0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTDP1Q9Y5B0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CTDP1Q9Y5B0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTDP1Q9Y5B0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTDP1Q9Y5B0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CTDP1Q9Y5B0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTDP1Q9Y5B0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTDP1Q9Y5B0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTDP1Q9Y5B0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTDP1Q9Y5B0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTDP1Q9Y5B0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTDP1Q9Y5B0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTDP1Q9Y5B0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTDP1Q9Y5B0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTDP1Q9Y5B0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTDP1Q9Y5B0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CTDP1Q9Y5B0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTDP1Q9Y5B0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTDP1Q9Y5B0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CTDP1Q9Y5B0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTDP1Q9Y5B0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTDP1Q9Y5B0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTDP1Q9Y5B0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CTDP1Q9Y5B0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTDP1Q9Y5B0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTDP1Q9Y5B0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTDP1Q9Y5B0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTDP1Q9Y5B0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CTDP1Q9Y5B0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTDP1Q9Y5B0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTDP1Q9Y5B0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTDP1Q9Y5B0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTDP1Q9Y5B0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTDP1Q9Y5B0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms