Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y587

AP4S1, AP-4 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4S1Q9Y587 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP4S1Q9Y587 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP4S1Q9Y587 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP4S1Q9Y587 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP4S1Q9Y587 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP4S1Q9Y587 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AP4S1Q9Y587 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP4S1Q9Y587 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP4S1Q9Y587 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP4S1Q9Y587 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP4S1Q9Y587 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP4S1Q9Y587 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP4S1Q9Y587 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP4S1Q9Y587 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP4S1Q9Y587 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP4S1Q9Y587 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP4S1Q9Y587 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP4S1Q9Y587 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP4S1Q9Y587 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP4S1Q9Y587 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP4S1Q9Y587 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP4S1Q9Y587 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP4S1Q9Y587 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AP4S1Q9Y587 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP4S1Q9Y587 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP4S1Q9Y587 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP4S1Q9Y587 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
AP4S1Q9Y587 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AP4S1Q9Y587 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
AP4S1Q9Y587 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms