Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRELID3BQ9Y3B1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRELID3BQ9Y3B1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRELID3BQ9Y3B1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms