Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCML1Q9UN30 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SCML1Q9UN30 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCML1Q9UN30 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCML1Q9UN30 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCML1Q9UN30 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCML1Q9UN30 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SCML1Q9UN30 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCML1Q9UN30 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCML1Q9UN30 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCML1Q9UN30 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SCML1Q9UN30 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCML1Q9UN30 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCML1Q9UN30 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCML1Q9UN30 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCML1Q9UN30 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCML1Q9UN30 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCML1Q9UN30 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCML1Q9UN30 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SCML1Q9UN30 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCML1Q9UN30 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCML1Q9UN30 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCML1Q9UN30 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCML1Q9UN30 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCML1Q9UN30 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCML1Q9UN30 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCML1Q9UN30 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCML1Q9UN30 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCML1Q9UN30 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCML1Q9UN30 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCML1Q9UN30 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SCML1Q9UN30 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCML1Q9UN30 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SCML1Q9UN30 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SCML1Q9UN30 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SCML1Q9UN30 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCML1Q9UN30 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCML1Q9UN30 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCML1Q9UN30 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCML1Q9UN30 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCML1Q9UN30 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCML1Q9UN30 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCML1Q9UN30 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCML1Q9UN30 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCML1Q9UN30 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SCML1Q9UN30 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCML1Q9UN30 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCML1Q9UN30 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCML1Q9UN30 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCML1Q9UN30 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCML1Q9UN30 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCML1Q9UN30 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCML1Q9UN30 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCML1Q9UN30 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCML1Q9UN30 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCML1Q9UN30 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCML1Q9UN30 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCML1Q9UN30 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCML1Q9UN30 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCML1Q9UN30 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCML1Q9UN30 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SCML1Q9UN30 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCML1Q9UN30 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms