Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM6

CNOT6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT6Q9ULM6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNOT6Q9ULM6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNOT6Q9ULM6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNOT6Q9ULM6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNOT6Q9ULM6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNOT6Q9ULM6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNOT6Q9ULM6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNOT6Q9ULM6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNOT6Q9ULM6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNOT6Q9ULM6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNOT6Q9ULM6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNOT6Q9ULM6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNOT6Q9ULM6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNOT6Q9ULM6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CNOT6Q9ULM6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNOT6Q9ULM6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNOT6Q9ULM6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNOT6Q9ULM6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNOT6Q9ULM6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNOT6Q9ULM6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNOT6Q9ULM6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNOT6Q9ULM6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CNOT6Q9ULM6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNOT6Q9ULM6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNOT6Q9ULM6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNOT6Q9ULM6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNOT6Q9ULM6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNOT6Q9ULM6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNOT6Q9ULM6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNOT6Q9ULM6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNOT6Q9ULM6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNOT6Q9ULM6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CNOT6Q9ULM6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNOT6Q9ULM6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNOT6Q9ULM6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNOT6Q9ULM6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNOT6Q9ULM6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNOT6Q9ULM6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNOT6Q9ULM6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CNOT6Q9ULM6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CNOT6Q9ULM6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNOT6Q9ULM6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNOT6Q9ULM6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNOT6Q9ULM6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNOT6Q9ULM6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNOT6Q9ULM6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNOT6Q9ULM6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNOT6Q9ULM6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNOT6Q9ULM6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNOT6Q9ULM6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNOT6Q9ULM6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNOT6Q9ULM6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNOT6Q9ULM6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNOT6Q9ULM6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNOT6Q9ULM6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNOT6Q9ULM6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms