Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MED23Q9ULK4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MED23Q9ULK4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MED23Q9ULK4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MED23Q9ULK4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MED23Q9ULK4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MED23Q9ULK4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MED23Q9ULK4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MED23Q9ULK4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MED23Q9ULK4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
MED23Q9ULK4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MED23Q9ULK4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MED23Q9ULK4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MED23Q9ULK4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MED23Q9ULK4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MED23Q9ULK4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MED23Q9ULK4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
MED23Q9ULK4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MED23Q9ULK4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MED23Q9ULK4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
MED23Q9ULK4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MED23Q9ULK4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MED23Q9ULK4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MED23Q9ULK4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MED23Q9ULK4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MED23Q9ULK4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MED23Q9ULK4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MED23Q9ULK4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MED23Q9ULK4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MED23Q9ULK4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MED23Q9ULK4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MED23Q9ULK4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MED23Q9ULK4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MED23Q9ULK4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MED23Q9ULK4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MED23Q9ULK4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MED23Q9ULK4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
MED23Q9ULK4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MED23Q9ULK4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MED23Q9ULK4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MED23Q9ULK4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MED23Q9ULK4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MED23Q9ULK4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MED23Q9ULK4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MED23Q9ULK4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
MED23Q9ULK4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
MED23Q9ULK4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
MED23Q9ULK4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
MED23Q9ULK4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
MED23Q9ULK4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
MED23Q9ULK4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MED23Q9ULK4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MED23Q9ULK4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MED23Q9ULK4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MED23Q9ULK4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MED23Q9ULK4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MED23Q9ULK4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MED23Q9ULK4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MED23Q9ULK4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MED23Q9ULK4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MED23Q9ULK4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MED23Q9ULK4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MED23Q9ULK4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MED23Q9ULK4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MED23Q9ULK4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MED23Q9ULK4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MED23Q9ULK4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MED23Q9ULK4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MED23Q9ULK4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MED23Q9ULK4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MED23Q9ULK4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
MED23Q9ULK4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MED23Q9ULK4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MED23Q9ULK4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MED23Q9ULK4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MED23Q9ULK4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MED23Q9ULK4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MED23Q9ULK4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
MED23Q9ULK4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MED23Q9ULK4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
MED23Q9ULK4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MED23Q9ULK4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MED23Q9ULK4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MED23Q9ULK4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MED23Q9ULK4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MED23Q9ULK4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MED23Q9ULK4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MED23Q9ULK4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MED23Q9ULK4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MED23Q9ULK4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
MED23Q9ULK4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MED23Q9ULK4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MED23Q9ULK4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MED23Q9ULK4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MED23Q9ULK4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MED23Q9ULK4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MED23Q9ULK4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms