Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSKSQ9UJT2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSKSQ9UJT2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSKSQ9UJT2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSKSQ9UJT2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSKSQ9UJT2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSKSQ9UJT2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSKSQ9UJT2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TSKSQ9UJT2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TSKSQ9UJT2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TSKSQ9UJT2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TSKSQ9UJT2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TSKSQ9UJT2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TSKSQ9UJT2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TSKSQ9UJT2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TSKSQ9UJT2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TSKSQ9UJT2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TSKSQ9UJT2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TSKSQ9UJT2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TSKSQ9UJT2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TSKSQ9UJT2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TSKSQ9UJT2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TSKSQ9UJT2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TSKSQ9UJT2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TSKSQ9UJT2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TSKSQ9UJT2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TSKSQ9UJT2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TSKSQ9UJT2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TSKSQ9UJT2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TSKSQ9UJT2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TSKSQ9UJT2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TSKSQ9UJT2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TSKSQ9UJT2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSKSQ9UJT2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSKSQ9UJT2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSKSQ9UJT2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSKSQ9UJT2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSKSQ9UJT2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TSKSQ9UJT2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSKSQ9UJT2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSKSQ9UJT2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSKSQ9UJT2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSKSQ9UJT2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSKSQ9UJT2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSKSQ9UJT2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSKSQ9UJT2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSKSQ9UJT2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TSKSQ9UJT2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSKSQ9UJT2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSKSQ9UJT2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSKSQ9UJT2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TSKSQ9UJT2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TSKSQ9UJT2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TSKSQ9UJT2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TSKSQ9UJT2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TSKSQ9UJT2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TSKSQ9UJT2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TSKSQ9UJT2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TSKSQ9UJT2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSKSQ9UJT2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TSKSQ9UJT2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSKSQ9UJT2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSKSQ9UJT2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSKSQ9UJT2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSKSQ9UJT2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSKSQ9UJT2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TSKSQ9UJT2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TSKSQ9UJT2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TSKSQ9UJT2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TSKSQ9UJT2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TSKSQ9UJT2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TSKSQ9UJT2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TSKSQ9UJT2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TSKSQ9UJT2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TSKSQ9UJT2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSKSQ9UJT2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSKSQ9UJT2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSKSQ9UJT2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSKSQ9UJT2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSKSQ9UJT2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSKSQ9UJT2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSKSQ9UJT2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSKSQ9UJT2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSKSQ9UJT2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSKSQ9UJT2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSKSQ9UJT2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSKSQ9UJT2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSKSQ9UJT2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSKSQ9UJT2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TSKSQ9UJT2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSKSQ9UJT2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TSKSQ9UJT2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TSKSQ9UJT2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TSKSQ9UJT2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TSKSQ9UJT2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TSKSQ9UJT2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TSKSQ9UJT2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TSKSQ9UJT2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TSKSQ9UJT2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TSKSQ9UJT2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms