Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SALL4Q9UJQ4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SALL4Q9UJQ4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SALL4Q9UJQ4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SALL4Q9UJQ4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SALL4Q9UJQ4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SALL4Q9UJQ4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SALL4Q9UJQ4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SALL4Q9UJQ4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SALL4Q9UJQ4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SALL4Q9UJQ4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SALL4Q9UJQ4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SALL4Q9UJQ4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SALL4Q9UJQ4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SALL4Q9UJQ4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SALL4Q9UJQ4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SALL4Q9UJQ4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SALL4Q9UJQ4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SALL4Q9UJQ4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SALL4Q9UJQ4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SALL4Q9UJQ4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SALL4Q9UJQ4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SALL4Q9UJQ4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SALL4Q9UJQ4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SALL4Q9UJQ4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SALL4Q9UJQ4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SALL4Q9UJQ4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SALL4Q9UJQ4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SALL4Q9UJQ4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SALL4Q9UJQ4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SALL4Q9UJQ4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SALL4Q9UJQ4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SALL4Q9UJQ4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SALL4Q9UJQ4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SALL4Q9UJQ4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SALL4Q9UJQ4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SALL4Q9UJQ4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SALL4Q9UJQ4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SALL4Q9UJQ4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms