Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII4

HERC5, E3 ISG15--protein ligase HERC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC5Q9UII4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HERC5Q9UII4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HERC5Q9UII4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HERC5Q9UII4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HERC5Q9UII4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HERC5Q9UII4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HERC5Q9UII4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
HERC5Q9UII4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
HERC5Q9UII4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HERC5Q9UII4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HERC5Q9UII4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HERC5Q9UII4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HERC5Q9UII4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HERC5Q9UII4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HERC5Q9UII4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HERC5Q9UII4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HERC5Q9UII4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
HERC5Q9UII4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HERC5Q9UII4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HERC5Q9UII4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HERC5Q9UII4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
HERC5Q9UII4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HERC5Q9UII4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HERC5Q9UII4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HERC5Q9UII4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HERC5Q9UII4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HERC5Q9UII4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HERC5Q9UII4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HERC5Q9UII4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HERC5Q9UII4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HERC5Q9UII4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HERC5Q9UII4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HERC5Q9UII4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HERC5Q9UII4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
HERC5Q9UII4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HERC5Q9UII4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HERC5Q9UII4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HERC5Q9UII4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HERC5Q9UII4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms