Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCF2Q9UG63 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCF2Q9UG63 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCF2Q9UG63 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCF2Q9UG63 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCF2Q9UG63 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCF2Q9UG63 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCF2Q9UG63 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCF2Q9UG63 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCF2Q9UG63 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCF2Q9UG63 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCF2Q9UG63 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCF2Q9UG63 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCF2Q9UG63 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCF2Q9UG63 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCF2Q9UG63 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ABCF2Q9UG63 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ABCF2Q9UG63 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ABCF2Q9UG63 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ABCF2Q9UG63 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ABCF2Q9UG63 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ABCF2Q9UG63 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCF2Q9UG63 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCF2Q9UG63 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCF2Q9UG63 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCF2Q9UG63 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCF2Q9UG63 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ABCF2Q9UG63 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ABCF2Q9UG63 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ABCF2Q9UG63 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ABCF2Q9UG63 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCF2Q9UG63 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCF2Q9UG63 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCF2Q9UG63 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCF2Q9UG63 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCF2Q9UG63 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ABCF2Q9UG63 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ABCF2Q9UG63 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ABCF2Q9UG63 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ABCF2Q9UG63 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ABCF2Q9UG63 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ABCF2Q9UG63 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ABCF2Q9UG63 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ABCF2Q9UG63 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ABCF2Q9UG63 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ABCF2Q9UG63 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ABCF2Q9UG63 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ABCF2Q9UG63 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ABCF2Q9UG63 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCF2Q9UG63 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCF2Q9UG63 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCF2Q9UG63 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCF2Q9UG63 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCF2Q9UG63 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCF2Q9UG63 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCF2Q9UG63 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCF2Q9UG63 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCF2Q9UG63 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCF2Q9UG63 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCF2Q9UG63 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCF2Q9UG63 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCF2Q9UG63 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCF2Q9UG63 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCF2Q9UG63 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCF2Q9UG63 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCF2Q9UG63 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCF2Q9UG63 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCF2Q9UG63 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCF2Q9UG63 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCF2Q9UG63 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCF2Q9UG63 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCF2Q9UG63 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCF2Q9UG63 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCF2Q9UG63 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCF2Q9UG63 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCF2Q9UG63 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCF2Q9UG63 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCF2Q9UG63 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCF2Q9UG63 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCF2Q9UG63 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCF2Q9UG63 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCF2Q9UG63 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCF2Q9UG63 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCF2Q9UG63 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCF2Q9UG63 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCF2Q9UG63 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCF2Q9UG63 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCF2Q9UG63 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCF2Q9UG63 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCF2Q9UG63 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCF2Q9UG63 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCF2Q9UG63 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCF2Q9UG63 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCF2Q9UG63 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCF2Q9UG63 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCF2Q9UG63 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCF2Q9UG63 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCF2Q9UG63 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCF2Q9UG63 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ABCF2Q9UG63 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms