Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY6

TRIM10, Tripartite motif-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM10Q9UDY6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM10Q9UDY6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM10Q9UDY6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM10Q9UDY6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM10Q9UDY6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM10Q9UDY6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM10Q9UDY6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM10Q9UDY6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM10Q9UDY6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM10Q9UDY6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM10Q9UDY6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM10Q9UDY6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM10Q9UDY6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM10Q9UDY6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM10Q9UDY6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM10Q9UDY6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM10Q9UDY6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM10Q9UDY6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM10Q9UDY6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM10Q9UDY6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM10Q9UDY6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM10Q9UDY6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM10Q9UDY6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM10Q9UDY6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM10Q9UDY6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM10Q9UDY6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIM10Q9UDY6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRIM10Q9UDY6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM10Q9UDY6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM10Q9UDY6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM10Q9UDY6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM10Q9UDY6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM10Q9UDY6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM10Q9UDY6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM10Q9UDY6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM10Q9UDY6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM10Q9UDY6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM10Q9UDY6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM10Q9UDY6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms