Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPASTQ9UBP0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPASTQ9UBP0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPASTQ9UBP0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPASTQ9UBP0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPASTQ9UBP0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPASTQ9UBP0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPASTQ9UBP0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPASTQ9UBP0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPASTQ9UBP0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPASTQ9UBP0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPASTQ9UBP0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPASTQ9UBP0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPASTQ9UBP0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPASTQ9UBP0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPASTQ9UBP0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPASTQ9UBP0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPASTQ9UBP0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SPASTQ9UBP0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPASTQ9UBP0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPASTQ9UBP0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPASTQ9UBP0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPASTQ9UBP0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPASTQ9UBP0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPASTQ9UBP0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPASTQ9UBP0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPASTQ9UBP0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPASTQ9UBP0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPASTQ9UBP0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPASTQ9UBP0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPASTQ9UBP0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SPASTQ9UBP0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SPASTQ9UBP0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPASTQ9UBP0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPASTQ9UBP0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPASTQ9UBP0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPASTQ9UBP0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPASTQ9UBP0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPASTQ9UBP0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPASTQ9UBP0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SPASTQ9UBP0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPASTQ9UBP0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPASTQ9UBP0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPASTQ9UBP0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SPASTQ9UBP0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPASTQ9UBP0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SPASTQ9UBP0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPASTQ9UBP0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPASTQ9UBP0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPASTQ9UBP0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPASTQ9UBP0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPASTQ9UBP0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPASTQ9UBP0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPASTQ9UBP0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPASTQ9UBP0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPASTQ9UBP0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SPASTQ9UBP0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPASTQ9UBP0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SPASTQ9UBP0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SPASTQ9UBP0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPASTQ9UBP0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPASTQ9UBP0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SPASTQ9UBP0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPASTQ9UBP0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPASTQ9UBP0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPASTQ9UBP0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPASTQ9UBP0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPASTQ9UBP0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPASTQ9UBP0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPASTQ9UBP0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPASTQ9UBP0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SPASTQ9UBP0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPASTQ9UBP0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPASTQ9UBP0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPASTQ9UBP0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPASTQ9UBP0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPASTQ9UBP0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPASTQ9UBP0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPASTQ9UBP0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPASTQ9UBP0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPASTQ9UBP0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPASTQ9UBP0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPASTQ9UBP0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPASTQ9UBP0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPASTQ9UBP0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPASTQ9UBP0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPASTQ9UBP0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPASTQ9UBP0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPASTQ9UBP0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPASTQ9UBP0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPASTQ9UBP0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPASTQ9UBP0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPASTQ9UBP0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPASTQ9UBP0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPASTQ9UBP0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPASTQ9UBP0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPASTQ9UBP0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPASTQ9UBP0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPASTQ9UBP0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPASTQ9UBP0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms