Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U7

SLC17A7, Vesicular glutamate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A7Q9P2U7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC17A7Q9P2U7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC17A7Q9P2U7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC17A7Q9P2U7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC17A7Q9P2U7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC17A7Q9P2U7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC17A7Q9P2U7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC17A7Q9P2U7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC17A7Q9P2U7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC17A7Q9P2U7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC17A7Q9P2U7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC17A7Q9P2U7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC17A7Q9P2U7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC17A7Q9P2U7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC17A7Q9P2U7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC17A7Q9P2U7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC17A7Q9P2U7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC17A7Q9P2U7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC17A7Q9P2U7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC17A7Q9P2U7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC17A7Q9P2U7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC17A7Q9P2U7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC17A7Q9P2U7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC17A7Q9P2U7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC17A7Q9P2U7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC17A7Q9P2U7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC17A7Q9P2U7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC17A7Q9P2U7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC17A7Q9P2U7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC17A7Q9P2U7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC17A7Q9P2U7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC17A7Q9P2U7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC17A7Q9P2U7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC17A7Q9P2U7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC17A7Q9P2U7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC17A7Q9P2U7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC17A7Q9P2U7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC17A7Q9P2U7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC17A7Q9P2U7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC17A7Q9P2U7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC17A7Q9P2U7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC17A7Q9P2U7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC17A7Q9P2U7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC17A7Q9P2U7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC17A7Q9P2U7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC17A7Q9P2U7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC17A7Q9P2U7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC17A7Q9P2U7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC17A7Q9P2U7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC17A7Q9P2U7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC17A7Q9P2U7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC17A7Q9P2U7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC17A7Q9P2U7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC17A7Q9P2U7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC17A7Q9P2U7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC17A7Q9P2U7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC17A7Q9P2U7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC17A7Q9P2U7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC17A7Q9P2U7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC17A7Q9P2U7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC17A7Q9P2U7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC17A7Q9P2U7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC17A7Q9P2U7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC17A7Q9P2U7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC17A7Q9P2U7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC17A7Q9P2U7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC17A7Q9P2U7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC17A7Q9P2U7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC17A7Q9P2U7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC17A7Q9P2U7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms