Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J5

LARS, Leucine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARSQ9P2J5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LARSQ9P2J5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LARSQ9P2J5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LARSQ9P2J5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LARSQ9P2J5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LARSQ9P2J5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LARSQ9P2J5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LARSQ9P2J5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LARSQ9P2J5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LARSQ9P2J5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LARSQ9P2J5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LARSQ9P2J5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LARSQ9P2J5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LARSQ9P2J5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LARSQ9P2J5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LARSQ9P2J5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LARSQ9P2J5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LARSQ9P2J5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LARSQ9P2J5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LARSQ9P2J5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LARSQ9P2J5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LARSQ9P2J5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LARSQ9P2J5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LARSQ9P2J5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LARSQ9P2J5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LARSQ9P2J5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LARSQ9P2J5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LARSQ9P2J5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LARSQ9P2J5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LARSQ9P2J5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LARSQ9P2J5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LARSQ9P2J5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LARSQ9P2J5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LARSQ9P2J5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LARSQ9P2J5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LARSQ9P2J5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LARSQ9P2J5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LARSQ9P2J5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LARSQ9P2J5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LARSQ9P2J5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LARSQ9P2J5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LARSQ9P2J5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LARSQ9P2J5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LARSQ9P2J5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LARSQ9P2J5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LARSQ9P2J5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LARSQ9P2J5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LARSQ9P2J5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LARSQ9P2J5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LARSQ9P2J5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LARSQ9P2J5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LARSQ9P2J5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LARSQ9P2J5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LARSQ9P2J5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LARSQ9P2J5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LARSQ9P2J5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LARSQ9P2J5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LARSQ9P2J5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LARSQ9P2J5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LARSQ9P2J5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LARSQ9P2J5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LARSQ9P2J5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LARSQ9P2J5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LARSQ9P2J5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LARSQ9P2J5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LARSQ9P2J5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LARSQ9P2J5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LARSQ9P2J5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LARSQ9P2J5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LARSQ9P2J5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LARSQ9P2J5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LARSQ9P2J5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LARSQ9P2J5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LARSQ9P2J5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LARSQ9P2J5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LARSQ9P2J5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LARSQ9P2J5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LARSQ9P2J5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LARSQ9P2J5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LARSQ9P2J5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LARSQ9P2J5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LARSQ9P2J5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LARSQ9P2J5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LARSQ9P2J5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LARSQ9P2J5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LARSQ9P2J5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LARSQ9P2J5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LARSQ9P2J5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LARSQ9P2J5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LARSQ9P2J5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LARSQ9P2J5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LARSQ9P2J5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LARSQ9P2J5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LARSQ9P2J5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LARSQ9P2J5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LARSQ9P2J5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LARSQ9P2J5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LARSQ9P2J5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LARSQ9P2J5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LARSQ9P2J5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms