Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR2

LRP1B, Low-density lipoprotein receptor-related protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 4,599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1BQ9NZR2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LRP1BQ9NZR2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRP1BQ9NZR2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms