Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRC6

SPTBN5, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN5Q9NRC6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SPTBN5Q9NRC6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPTBN5Q9NRC6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPTBN5Q9NRC6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPTBN5Q9NRC6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPTBN5Q9NRC6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPTBN5Q9NRC6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SPTBN5Q9NRC6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPTBN5Q9NRC6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPTBN5Q9NRC6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPTBN5Q9NRC6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPTBN5Q9NRC6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPTBN5Q9NRC6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPTBN5Q9NRC6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPTBN5Q9NRC6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPTBN5Q9NRC6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPTBN5Q9NRC6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPTBN5Q9NRC6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPTBN5Q9NRC6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SPTBN5Q9NRC6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SPTBN5Q9NRC6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPTBN5Q9NRC6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPTBN5Q9NRC6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPTBN5Q9NRC6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPTBN5Q9NRC6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SPTBN5Q9NRC6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPTBN5Q9NRC6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPTBN5Q9NRC6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPTBN5Q9NRC6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPTBN5Q9NRC6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPTBN5Q9NRC6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPTBN5Q9NRC6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPTBN5Q9NRC6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SPTBN5Q9NRC6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPTBN5Q9NRC6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPTBN5Q9NRC6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPTBN5Q9NRC6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPTBN5Q9NRC6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPTBN5Q9NRC6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SPTBN5Q9NRC6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPTBN5Q9NRC6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPTBN5Q9NRC6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPTBN5Q9NRC6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPTBN5Q9NRC6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPTBN5Q9NRC6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPTBN5Q9NRC6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPTBN5Q9NRC6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SPTBN5Q9NRC6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPTBN5Q9NRC6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPTBN5Q9NRC6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPTBN5Q9NRC6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPTBN5Q9NRC6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPTBN5Q9NRC6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPTBN5Q9NRC6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPTBN5Q9NRC6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPTBN5Q9NRC6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPTBN5Q9NRC6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPTBN5Q9NRC6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPTBN5Q9NRC6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPTBN5Q9NRC6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SPTBN5Q9NRC6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPTBN5Q9NRC6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPTBN5Q9NRC6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPTBN5Q9NRC6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPTBN5Q9NRC6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPTBN5Q9NRC6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPTBN5Q9NRC6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPTBN5Q9NRC6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPTBN5Q9NRC6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SPTBN5Q9NRC6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SPTBN5Q9NRC6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPTBN5Q9NRC6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPTBN5Q9NRC6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPTBN5Q9NRC6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPTBN5Q9NRC6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SPTBN5Q9NRC6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPTBN5Q9NRC6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPTBN5Q9NRC6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPTBN5Q9NRC6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SPTBN5Q9NRC6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPTBN5Q9NRC6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPTBN5Q9NRC6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPTBN5Q9NRC6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPTBN5Q9NRC6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPTBN5Q9NRC6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPTBN5Q9NRC6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPTBN5Q9NRC6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPTBN5Q9NRC6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SPTBN5Q9NRC6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPTBN5Q9NRC6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPTBN5Q9NRC6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SPTBN5Q9NRC6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPTBN5Q9NRC6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPTBN5Q9NRC6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPTBN5Q9NRC6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPTBN5Q9NRC6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPTBN5Q9NRC6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPTBN5Q9NRC6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPTBN5Q9NRC6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPTBN5Q9NRC6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms