Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG8

ZDHHC4, Probable palmitoyltransferase ZDHHC4, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC4Q9NPG8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZDHHC4Q9NPG8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZDHHC4Q9NPG8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZDHHC4Q9NPG8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ZDHHC4Q9NPG8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZDHHC4Q9NPG8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZDHHC4Q9NPG8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZDHHC4Q9NPG8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZDHHC4Q9NPG8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZDHHC4Q9NPG8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZDHHC4Q9NPG8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZDHHC4Q9NPG8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZDHHC4Q9NPG8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZDHHC4Q9NPG8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZDHHC4Q9NPG8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZDHHC4Q9NPG8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZDHHC4Q9NPG8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZDHHC4Q9NPG8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ZDHHC4Q9NPG8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZDHHC4Q9NPG8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZDHHC4Q9NPG8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZDHHC4Q9NPG8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ZDHHC4Q9NPG8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZDHHC4Q9NPG8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZDHHC4Q9NPG8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZDHHC4Q9NPG8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZDHHC4Q9NPG8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZDHHC4Q9NPG8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZDHHC4Q9NPG8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZDHHC4Q9NPG8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZDHHC4Q9NPG8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZDHHC4Q9NPG8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZDHHC4Q9NPG8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZDHHC4Q9NPG8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZDHHC4Q9NPG8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZDHHC4Q9NPG8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZDHHC4Q9NPG8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZDHHC4Q9NPG8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZDHHC4Q9NPG8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZDHHC4Q9NPG8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZDHHC4Q9NPG8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZDHHC4Q9NPG8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZDHHC4Q9NPG8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZDHHC4Q9NPG8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZDHHC4Q9NPG8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ZDHHC4Q9NPG8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZDHHC4Q9NPG8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ZDHHC4Q9NPG8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ZDHHC4Q9NPG8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZDHHC4Q9NPG8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZDHHC4Q9NPG8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZDHHC4Q9NPG8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZDHHC4Q9NPG8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZDHHC4Q9NPG8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZDHHC4Q9NPG8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZDHHC4Q9NPG8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZDHHC4Q9NPG8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZDHHC4Q9NPG8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZDHHC4Q9NPG8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZDHHC4Q9NPG8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZDHHC4Q9NPG8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms