Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP79

VTA1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTA1Q9NP79 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VTA1Q9NP79 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
VTA1Q9NP79 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
VTA1Q9NP79 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VTA1Q9NP79 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VTA1Q9NP79 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VTA1Q9NP79 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VTA1Q9NP79 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VTA1Q9NP79 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VTA1Q9NP79 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
VTA1Q9NP79 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
VTA1Q9NP79 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
VTA1Q9NP79 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VTA1Q9NP79 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VTA1Q9NP79 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VTA1Q9NP79 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VTA1Q9NP79 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VTA1Q9NP79 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VTA1Q9NP79 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VTA1Q9NP79 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VTA1Q9NP79 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VTA1Q9NP79 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VTA1Q9NP79 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VTA1Q9NP79 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VTA1Q9NP79 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VTA1Q9NP79 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VTA1Q9NP79 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VTA1Q9NP79 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VTA1Q9NP79 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
VTA1Q9NP79 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VTA1Q9NP79 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VTA1Q9NP79 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VTA1Q9NP79 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VTA1Q9NP79 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VTA1Q9NP79 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VTA1Q9NP79 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
VTA1Q9NP79 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VTA1Q9NP79 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VTA1Q9NP79 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VTA1Q9NP79 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VTA1Q9NP79 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VTA1Q9NP79 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VTA1Q9NP79 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VTA1Q9NP79 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
VTA1Q9NP79 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VTA1Q9NP79 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VTA1Q9NP79 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VTA1Q9NP79 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VTA1Q9NP79 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VTA1Q9NP79 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VTA1Q9NP79 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VTA1Q9NP79 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VTA1Q9NP79 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VTA1Q9NP79 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VTA1Q9NP79 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VTA1Q9NP79 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VTA1Q9NP79 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VTA1Q9NP79 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VTA1Q9NP79 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
VTA1Q9NP79 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms