Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXNA4Q9HCM2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXNA4Q9HCM2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXNA4Q9HCM2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXNA4Q9HCM2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXNA4Q9HCM2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXNA4Q9HCM2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXNA4Q9HCM2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXNA4Q9HCM2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXNA4Q9HCM2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXNA4Q9HCM2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXNA4Q9HCM2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXNA4Q9HCM2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXNA4Q9HCM2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLXNA4Q9HCM2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXNA4Q9HCM2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXNA4Q9HCM2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXNA4Q9HCM2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXNA4Q9HCM2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXNA4Q9HCM2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXNA4Q9HCM2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXNA4Q9HCM2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLXNA4Q9HCM2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLXNA4Q9HCM2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLXNA4Q9HCM2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLXNA4Q9HCM2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLXNA4Q9HCM2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLXNA4Q9HCM2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLXNA4Q9HCM2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLXNA4Q9HCM2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLXNA4Q9HCM2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PLXNA4Q9HCM2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLXNA4Q9HCM2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLXNA4Q9HCM2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLXNA4Q9HCM2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLXNA4Q9HCM2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PLXNA4Q9HCM2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PLXNA4Q9HCM2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLXNA4Q9HCM2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLXNA4Q9HCM2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLXNA4Q9HCM2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLXNA4Q9HCM2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLXNA4Q9HCM2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PLXNA4Q9HCM2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLXNA4Q9HCM2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLXNA4Q9HCM2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLXNA4Q9HCM2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLXNA4Q9HCM2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLXNA4Q9HCM2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLXNA4Q9HCM2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PLXNA4Q9HCM2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLXNA4Q9HCM2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLXNA4Q9HCM2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLXNA4Q9HCM2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLXNA4Q9HCM2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLXNA4Q9HCM2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PLXNA4Q9HCM2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLXNA4Q9HCM2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PLXNA4Q9HCM2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PLXNA4Q9HCM2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLXNA4Q9HCM2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLXNA4Q9HCM2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLXNA4Q9HCM2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLXNA4Q9HCM2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLXNA4Q9HCM2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLXNA4Q9HCM2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLXNA4Q9HCM2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLXNA4Q9HCM2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLXNA4Q9HCM2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLXNA4Q9HCM2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLXNA4Q9HCM2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLXNA4Q9HCM2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLXNA4Q9HCM2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLXNA4Q9HCM2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PLXNA4Q9HCM2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLXNA4Q9HCM2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLXNA4Q9HCM2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLXNA4Q9HCM2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLXNA4Q9HCM2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLXNA4Q9HCM2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLXNA4Q9HCM2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PLXNA4Q9HCM2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLXNA4Q9HCM2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PLXNA4Q9HCM2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLXNA4Q9HCM2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PLXNA4Q9HCM2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLXNA4Q9HCM2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLXNA4Q9HCM2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLXNA4Q9HCM2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLXNA4Q9HCM2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLXNA4Q9HCM2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLXNA4Q9HCM2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLXNA4Q9HCM2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLXNA4Q9HCM2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLXNA4Q9HCM2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLXNA4Q9HCM2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLXNA4Q9HCM2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLXNA4Q9HCM2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLXNA4Q9HCM2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PLXNA4Q9HCM2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms