Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8Y1

VRTN, Vertnin, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VRTNQ9H8Y1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VRTNQ9H8Y1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VRTNQ9H8Y1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VRTNQ9H8Y1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VRTNQ9H8Y1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VRTNQ9H8Y1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VRTNQ9H8Y1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VRTNQ9H8Y1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VRTNQ9H8Y1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VRTNQ9H8Y1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VRTNQ9H8Y1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VRTNQ9H8Y1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VRTNQ9H8Y1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VRTNQ9H8Y1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VRTNQ9H8Y1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VRTNQ9H8Y1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VRTNQ9H8Y1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
VRTNQ9H8Y1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VRTNQ9H8Y1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VRTNQ9H8Y1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VRTNQ9H8Y1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VRTNQ9H8Y1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VRTNQ9H8Y1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VRTNQ9H8Y1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VRTNQ9H8Y1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VRTNQ9H8Y1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VRTNQ9H8Y1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VRTNQ9H8Y1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VRTNQ9H8Y1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VRTNQ9H8Y1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VRTNQ9H8Y1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VRTNQ9H8Y1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VRTNQ9H8Y1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VRTNQ9H8Y1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VRTNQ9H8Y1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VRTNQ9H8Y1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VRTNQ9H8Y1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VRTNQ9H8Y1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VRTNQ9H8Y1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VRTNQ9H8Y1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VRTNQ9H8Y1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VRTNQ9H8Y1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VRTNQ9H8Y1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VRTNQ9H8Y1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VRTNQ9H8Y1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VRTNQ9H8Y1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VRTNQ9H8Y1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
VRTNQ9H8Y1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VRTNQ9H8Y1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VRTNQ9H8Y1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VRTNQ9H8Y1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VRTNQ9H8Y1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VRTNQ9H8Y1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VRTNQ9H8Y1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VRTNQ9H8Y1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VRTNQ9H8Y1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VRTNQ9H8Y1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VRTNQ9H8Y1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
VRTNQ9H8Y1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
VRTNQ9H8Y1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
VRTNQ9H8Y1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VRTNQ9H8Y1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VRTNQ9H8Y1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VRTNQ9H8Y1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VRTNQ9H8Y1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VRTNQ9H8Y1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VRTNQ9H8Y1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VRTNQ9H8Y1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VRTNQ9H8Y1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VRTNQ9H8Y1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VRTNQ9H8Y1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VRTNQ9H8Y1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VRTNQ9H8Y1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VRTNQ9H8Y1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VRTNQ9H8Y1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VRTNQ9H8Y1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VRTNQ9H8Y1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VRTNQ9H8Y1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VRTNQ9H8Y1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VRTNQ9H8Y1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VRTNQ9H8Y1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VRTNQ9H8Y1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VRTNQ9H8Y1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VRTNQ9H8Y1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VRTNQ9H8Y1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
VRTNQ9H8Y1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
VRTNQ9H8Y1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VRTNQ9H8Y1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VRTNQ9H8Y1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VRTNQ9H8Y1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VRTNQ9H8Y1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VRTNQ9H8Y1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VRTNQ9H8Y1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VRTNQ9H8Y1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VRTNQ9H8Y1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
VRTNQ9H8Y1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VRTNQ9H8Y1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VRTNQ9H8Y1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VRTNQ9H8Y1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VRTNQ9H8Y1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms