Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E9

C8orf33, UPF0488 protein C8orf33, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf33Q9H7E9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C8orf33Q9H7E9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C8orf33Q9H7E9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C8orf33Q9H7E9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C8orf33Q9H7E9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C8orf33Q9H7E9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C8orf33Q9H7E9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C8orf33Q9H7E9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C8orf33Q9H7E9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C8orf33Q9H7E9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C8orf33Q9H7E9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C8orf33Q9H7E9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C8orf33Q9H7E9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C8orf33Q9H7E9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C8orf33Q9H7E9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C8orf33Q9H7E9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C8orf33Q9H7E9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C8orf33Q9H7E9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C8orf33Q9H7E9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C8orf33Q9H7E9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C8orf33Q9H7E9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C8orf33Q9H7E9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C8orf33Q9H7E9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C8orf33Q9H7E9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C8orf33Q9H7E9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C8orf33Q9H7E9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C8orf33Q9H7E9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C8orf33Q9H7E9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C8orf33Q9H7E9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C8orf33Q9H7E9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C8orf33Q9H7E9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C8orf33Q9H7E9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C8orf33Q9H7E9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C8orf33Q9H7E9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C8orf33Q9H7E9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C8orf33Q9H7E9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C8orf33Q9H7E9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C8orf33Q9H7E9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C8orf33Q9H7E9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C8orf33Q9H7E9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C8orf33Q9H7E9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
C8orf33Q9H7E9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C8orf33Q9H7E9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C8orf33Q9H7E9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C8orf33Q9H7E9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C8orf33Q9H7E9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C8orf33Q9H7E9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C8orf33Q9H7E9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C8orf33Q9H7E9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C8orf33Q9H7E9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C8orf33Q9H7E9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C8orf33Q9H7E9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C8orf33Q9H7E9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C8orf33Q9H7E9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C8orf33Q9H7E9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C8orf33Q9H7E9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C8orf33Q9H7E9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C8orf33Q9H7E9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
C8orf33Q9H7E9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C8orf33Q9H7E9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C8orf33Q9H7E9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C8orf33Q9H7E9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C8orf33Q9H7E9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
C8orf33Q9H7E9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C8orf33Q9H7E9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C8orf33Q9H7E9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C8orf33Q9H7E9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C8orf33Q9H7E9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C8orf33Q9H7E9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C8orf33Q9H7E9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C8orf33Q9H7E9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C8orf33Q9H7E9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C8orf33Q9H7E9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C8orf33Q9H7E9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
C8orf33Q9H7E9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
C8orf33Q9H7E9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C8orf33Q9H7E9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
C8orf33Q9H7E9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C8orf33Q9H7E9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C8orf33Q9H7E9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C8orf33Q9H7E9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C8orf33Q9H7E9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C8orf33Q9H7E9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C8orf33Q9H7E9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
C8orf33Q9H7E9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C8orf33Q9H7E9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C8orf33Q9H7E9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C8orf33Q9H7E9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C8orf33Q9H7E9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C8orf33Q9H7E9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C8orf33Q9H7E9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C8orf33Q9H7E9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C8orf33Q9H7E9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C8orf33Q9H7E9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C8orf33Q9H7E9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C8orf33Q9H7E9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C8orf33Q9H7E9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C8orf33Q9H7E9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C8orf33Q9H7E9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C8orf33Q9H7E9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms