Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RPAP3Q9H6T3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPAP3Q9H6T3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPAP3Q9H6T3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
RPAP3Q9H6T3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
RPAP3Q9H6T3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPAP3Q9H6T3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPAP3Q9H6T3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPAP3Q9H6T3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPAP3Q9H6T3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPAP3Q9H6T3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPAP3Q9H6T3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RPAP3Q9H6T3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RPAP3Q9H6T3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPAP3Q9H6T3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RPAP3Q9H6T3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPAP3Q9H6T3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPAP3Q9H6T3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPAP3Q9H6T3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPAP3Q9H6T3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPAP3Q9H6T3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPAP3Q9H6T3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPAP3Q9H6T3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPAP3Q9H6T3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPAP3Q9H6T3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPAP3Q9H6T3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPAP3Q9H6T3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPAP3Q9H6T3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPAP3Q9H6T3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPAP3Q9H6T3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPAP3Q9H6T3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPAP3Q9H6T3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPAP3Q9H6T3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPAP3Q9H6T3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPAP3Q9H6T3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPAP3Q9H6T3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPAP3Q9H6T3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPAP3Q9H6T3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RPAP3Q9H6T3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPAP3Q9H6T3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPAP3Q9H6T3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPAP3Q9H6T3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPAP3Q9H6T3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPAP3Q9H6T3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPAP3Q9H6T3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPAP3Q9H6T3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPAP3Q9H6T3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPAP3Q9H6T3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPAP3Q9H6T3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
RPAP3Q9H6T3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPAP3Q9H6T3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
RPAP3Q9H6T3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPAP3Q9H6T3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPAP3Q9H6T3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPAP3Q9H6T3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPAP3Q9H6T3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPAP3Q9H6T3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPAP3Q9H6T3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPAP3Q9H6T3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPAP3Q9H6T3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPAP3Q9H6T3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPAP3Q9H6T3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPAP3Q9H6T3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPAP3Q9H6T3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPAP3Q9H6T3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPAP3Q9H6T3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPAP3Q9H6T3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPAP3Q9H6T3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
RPAP3Q9H6T3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
RPAP3Q9H6T3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPAP3Q9H6T3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPAP3Q9H6T3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPAP3Q9H6T3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPAP3Q9H6T3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPAP3Q9H6T3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPAP3Q9H6T3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPAP3Q9H6T3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPAP3Q9H6T3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPAP3Q9H6T3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPAP3Q9H6T3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPAP3Q9H6T3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPAP3Q9H6T3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPAP3Q9H6T3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPAP3Q9H6T3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPAP3Q9H6T3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPAP3Q9H6T3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPAP3Q9H6T3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPAP3Q9H6T3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPAP3Q9H6T3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPAP3Q9H6T3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPAP3Q9H6T3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPAP3Q9H6T3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RPAP3Q9H6T3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPAP3Q9H6T3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPAP3Q9H6T3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPAP3Q9H6T3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPAP3Q9H6T3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPAP3Q9H6T3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RPAP3Q9H6T3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPAP3Q9H6T3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms