Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2E6

SEMA6A, Semaphorin-6A, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6AQ9H2E6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA6AQ9H2E6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SEMA6AQ9H2E6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA6AQ9H2E6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
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