Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR1

SENP6, Sentrin-specific protease 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6Q9GZR1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SENP6Q9GZR1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SENP6Q9GZR1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SENP6Q9GZR1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SENP6Q9GZR1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SENP6Q9GZR1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SENP6Q9GZR1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SENP6Q9GZR1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SENP6Q9GZR1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SENP6Q9GZR1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SENP6Q9GZR1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SENP6Q9GZR1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SENP6Q9GZR1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SENP6Q9GZR1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SENP6Q9GZR1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SENP6Q9GZR1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SENP6Q9GZR1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SENP6Q9GZR1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SENP6Q9GZR1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SENP6Q9GZR1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SENP6Q9GZR1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SENP6Q9GZR1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SENP6Q9GZR1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SENP6Q9GZR1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SENP6Q9GZR1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SENP6Q9GZR1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SENP6Q9GZR1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SENP6Q9GZR1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SENP6Q9GZR1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SENP6Q9GZR1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SENP6Q9GZR1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SENP6Q9GZR1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SENP6Q9GZR1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SENP6Q9GZR1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SENP6Q9GZR1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SENP6Q9GZR1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SENP6Q9GZR1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SENP6Q9GZR1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SENP6Q9GZR1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SENP6Q9GZR1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SENP6Q9GZR1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SENP6Q9GZR1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SENP6Q9GZR1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SENP6Q9GZR1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SENP6Q9GZR1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SENP6Q9GZR1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SENP6Q9GZR1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SENP6Q9GZR1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SENP6Q9GZR1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SENP6Q9GZR1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SENP6Q9GZR1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SENP6Q9GZR1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SENP6Q9GZR1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SENP6Q9GZR1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SENP6Q9GZR1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SENP6Q9GZR1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SENP6Q9GZR1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SENP6Q9GZR1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SENP6Q9GZR1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SENP6Q9GZR1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SENP6Q9GZR1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SENP6Q9GZR1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SENP6Q9GZR1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SENP6Q9GZR1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SENP6Q9GZR1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SENP6Q9GZR1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SENP6Q9GZR1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SENP6Q9GZR1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SENP6Q9GZR1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SENP6Q9GZR1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SENP6Q9GZR1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SENP6Q9GZR1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SENP6Q9GZR1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SENP6Q9GZR1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SENP6Q9GZR1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SENP6Q9GZR1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SENP6Q9GZR1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SENP6Q9GZR1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SENP6Q9GZR1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SENP6Q9GZR1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SENP6Q9GZR1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SENP6Q9GZR1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SENP6Q9GZR1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SENP6Q9GZR1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SENP6Q9GZR1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SENP6Q9GZR1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SENP6Q9GZR1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SENP6Q9GZR1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SENP6Q9GZR1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SENP6Q9GZR1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SENP6Q9GZR1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SENP6Q9GZR1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SENP6Q9GZR1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SENP6Q9GZR1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SENP6Q9GZR1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SENP6Q9GZR1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SENP6Q9GZR1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SENP6Q9GZR1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SENP6Q9GZR1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SENP6Q9GZR1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms