Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LNPKQ9C0E8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LNPKQ9C0E8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LNPKQ9C0E8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LNPKQ9C0E8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LNPKQ9C0E8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LNPKQ9C0E8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LNPKQ9C0E8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
LNPKQ9C0E8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
LNPKQ9C0E8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LNPKQ9C0E8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LNPKQ9C0E8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LNPKQ9C0E8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LNPKQ9C0E8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LNPKQ9C0E8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LNPKQ9C0E8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LNPKQ9C0E8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LNPKQ9C0E8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LNPKQ9C0E8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LNPKQ9C0E8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LNPKQ9C0E8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LNPKQ9C0E8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LNPKQ9C0E8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LNPKQ9C0E8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LNPKQ9C0E8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LNPKQ9C0E8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LNPKQ9C0E8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LNPKQ9C0E8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LNPKQ9C0E8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LNPKQ9C0E8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LNPKQ9C0E8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LNPKQ9C0E8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LNPKQ9C0E8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LNPKQ9C0E8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LNPKQ9C0E8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LNPKQ9C0E8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LNPKQ9C0E8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LNPKQ9C0E8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LNPKQ9C0E8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms