Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D3

ZYG11B, Protein zyg-11 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZYG11BQ9C0D3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZYG11BQ9C0D3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZYG11BQ9C0D3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZYG11BQ9C0D3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZYG11BQ9C0D3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZYG11BQ9C0D3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZYG11BQ9C0D3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZYG11BQ9C0D3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZYG11BQ9C0D3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZYG11BQ9C0D3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZYG11BQ9C0D3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZYG11BQ9C0D3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZYG11BQ9C0D3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZYG11BQ9C0D3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZYG11BQ9C0D3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZYG11BQ9C0D3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZYG11BQ9C0D3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZYG11BQ9C0D3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZYG11BQ9C0D3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZYG11BQ9C0D3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZYG11BQ9C0D3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZYG11BQ9C0D3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ZYG11BQ9C0D3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ZYG11BQ9C0D3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ZYG11BQ9C0D3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ZYG11BQ9C0D3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZYG11BQ9C0D3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZYG11BQ9C0D3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZYG11BQ9C0D3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZYG11BQ9C0D3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZYG11BQ9C0D3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZYG11BQ9C0D3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZYG11BQ9C0D3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZYG11BQ9C0D3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZYG11BQ9C0D3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZYG11BQ9C0D3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZYG11BQ9C0D3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZYG11BQ9C0D3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZYG11BQ9C0D3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZYG11BQ9C0D3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZYG11BQ9C0D3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZYG11BQ9C0D3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZYG11BQ9C0D3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ZYG11BQ9C0D3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZYG11BQ9C0D3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ZYG11BQ9C0D3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZYG11BQ9C0D3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZYG11BQ9C0D3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZYG11BQ9C0D3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZYG11BQ9C0D3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZYG11BQ9C0D3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZYG11BQ9C0D3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZYG11BQ9C0D3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZYG11BQ9C0D3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZYG11BQ9C0D3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZYG11BQ9C0D3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZYG11BQ9C0D3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZYG11BQ9C0D3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
ZYG11BQ9C0D3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZYG11BQ9C0D3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZYG11BQ9C0D3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZYG11BQ9C0D3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZYG11BQ9C0D3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZYG11BQ9C0D3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZYG11BQ9C0D3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZYG11BQ9C0D3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ZYG11BQ9C0D3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZYG11BQ9C0D3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZYG11BQ9C0D3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZYG11BQ9C0D3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZYG11BQ9C0D3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZYG11BQ9C0D3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZYG11BQ9C0D3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZYG11BQ9C0D3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZYG11BQ9C0D3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZYG11BQ9C0D3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZYG11BQ9C0D3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZYG11BQ9C0D3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZYG11BQ9C0D3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZYG11BQ9C0D3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZYG11BQ9C0D3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZYG11BQ9C0D3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZYG11BQ9C0D3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZYG11BQ9C0D3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZYG11BQ9C0D3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZYG11BQ9C0D3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZYG11BQ9C0D3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZYG11BQ9C0D3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZYG11BQ9C0D3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZYG11BQ9C0D3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZYG11BQ9C0D3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZYG11BQ9C0D3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZYG11BQ9C0D3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZYG11BQ9C0D3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZYG11BQ9C0D3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZYG11BQ9C0D3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZYG11BQ9C0D3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZYG11BQ9C0D3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZYG11BQ9C0D3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZYG11BQ9C0D3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms