Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS1

KRTAP1-5, Keratin-associated protein 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-5Q9BYS1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP1-5Q9BYS1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-5Q9BYS1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-5Q9BYS1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-5Q9BYS1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-5Q9BYS1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-5Q9BYS1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-5Q9BYS1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-5Q9BYS1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-5Q9BYS1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-5Q9BYS1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-5Q9BYS1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-5Q9BYS1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-5Q9BYS1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-5Q9BYS1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-5Q9BYS1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-5Q9BYS1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-5Q9BYS1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-5Q9BYS1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-5Q9BYS1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-5Q9BYS1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-5Q9BYS1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-5Q9BYS1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-5Q9BYS1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-5Q9BYS1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-5Q9BYS1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-5Q9BYS1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-5Q9BYS1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-5Q9BYS1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-5Q9BYS1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-5Q9BYS1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-5Q9BYS1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-5Q9BYS1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-5Q9BYS1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-5Q9BYS1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP1-5Q9BYS1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP1-5Q9BYS1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP1-5Q9BYS1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP1-5Q9BYS1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP1-5Q9BYS1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms