Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
KDM5DQ9BY66 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
KDM5DQ9BY66 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
KDM5DQ9BY66 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
KDM5DQ9BY66 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
KDM5DQ9BY66 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
KDM5DQ9BY66 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
KDM5DQ9BY66 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
KDM5DQ9BY66 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
KDM5DQ9BY66 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
KDM5DQ9BY66 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
KDM5DQ9BY66 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
KDM5DQ9BY66 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
KDM5DQ9BY66 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
KDM5DQ9BY66 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
KDM5DQ9BY66 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
KDM5DQ9BY66 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
KDM5DQ9BY66 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
KDM5DQ9BY66 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
KDM5DQ9BY66 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
KDM5DQ9BY66 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
KDM5DQ9BY66 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
KDM5DQ9BY66 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
KDM5DQ9BY66 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
KDM5DQ9BY66 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
KDM5DQ9BY66 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
KDM5DQ9BY66 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
KDM5DQ9BY66 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
KDM5DQ9BY66 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
KDM5DQ9BY66 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
KDM5DQ9BY66 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
KDM5DQ9BY66 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
KDM5DQ9BY66 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
KDM5DQ9BY66 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
KDM5DQ9BY66 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
KDM5DQ9BY66 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
KDM5DQ9BY66 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
KDM5DQ9BY66 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
KDM5DQ9BY66 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
KDM5DQ9BY66 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
KDM5DQ9BY66 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
KDM5DQ9BY66 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
KDM5DQ9BY66 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
KDM5DQ9BY66 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
KDM5DQ9BY66 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
KDM5DQ9BY66 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
KDM5DQ9BY66 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
KDM5DQ9BY66 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
KDM5DQ9BY66 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
KDM5DQ9BY66 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
KDM5DQ9BY66 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
KDM5DQ9BY66 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
KDM5DQ9BY66 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
KDM5DQ9BY66 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
KDM5DQ9BY66 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
KDM5DQ9BY66 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
KDM5DQ9BY66 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
KDM5DQ9BY66 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
KDM5DQ9BY66 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
KDM5DQ9BY66 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
KDM5DQ9BY66 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
KDM5DQ9BY66 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
KDM5DQ9BY66 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
KDM5DQ9BY66 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
KDM5DQ9BY66 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
KDM5DQ9BY66 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
KDM5DQ9BY66 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
KDM5DQ9BY66 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
KDM5DQ9BY66 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
KDM5DQ9BY66 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
KDM5DQ9BY66 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
KDM5DQ9BY66 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
KDM5DQ9BY66 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
KDM5DQ9BY66 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
KDM5DQ9BY66 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
KDM5DQ9BY66 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
KDM5DQ9BY66 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
KDM5DQ9BY66 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
KDM5DQ9BY66 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
KDM5DQ9BY66 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
KDM5DQ9BY66 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
KDM5DQ9BY66 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
KDM5DQ9BY66 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
KDM5DQ9BY66 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
KDM5DQ9BY66 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
KDM5DQ9BY66 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
KDM5DQ9BY66 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
KDM5DQ9BY66 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
KDM5DQ9BY66 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
KDM5DQ9BY66 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
KDM5DQ9BY66 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
KDM5DQ9BY66 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
KDM5DQ9BY66 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
KDM5DQ9BY66 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
KDM5DQ9BY66 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
KDM5DQ9BY66 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
KDM5DQ9BY66 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
KDM5DQ9BY66 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
KDM5DQ9BY66 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
KDM5DQ9BY66 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 201.3 ms