Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VN1R3Q9BXE9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VN1R3Q9BXE9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VN1R3Q9BXE9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
VN1R3Q9BXE9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
VN1R3Q9BXE9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VN1R3Q9BXE9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VN1R3Q9BXE9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VN1R3Q9BXE9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
VN1R3Q9BXE9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VN1R3Q9BXE9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VN1R3Q9BXE9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VN1R3Q9BXE9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VN1R3Q9BXE9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VN1R3Q9BXE9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VN1R3Q9BXE9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VN1R3Q9BXE9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VN1R3Q9BXE9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VN1R3Q9BXE9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VN1R3Q9BXE9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
VN1R3Q9BXE9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VN1R3Q9BXE9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VN1R3Q9BXE9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VN1R3Q9BXE9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
VN1R3Q9BXE9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VN1R3Q9BXE9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VN1R3Q9BXE9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VN1R3Q9BXE9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VN1R3Q9BXE9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VN1R3Q9BXE9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VN1R3Q9BXE9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VN1R3Q9BXE9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VN1R3Q9BXE9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VN1R3Q9BXE9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
VN1R3Q9BXE9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VN1R3Q9BXE9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VN1R3Q9BXE9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VN1R3Q9BXE9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VN1R3Q9BXE9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VN1R3Q9BXE9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VN1R3Q9BXE9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VN1R3Q9BXE9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VN1R3Q9BXE9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VN1R3Q9BXE9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VN1R3Q9BXE9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VN1R3Q9BXE9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VN1R3Q9BXE9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VN1R3Q9BXE9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VN1R3Q9BXE9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VN1R3Q9BXE9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VN1R3Q9BXE9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VN1R3Q9BXE9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms