Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP4

PAAF1, Proteasomal ATPase-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAAF1Q9BRP4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PAAF1Q9BRP4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PAAF1Q9BRP4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PAAF1Q9BRP4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PAAF1Q9BRP4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PAAF1Q9BRP4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PAAF1Q9BRP4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PAAF1Q9BRP4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PAAF1Q9BRP4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PAAF1Q9BRP4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PAAF1Q9BRP4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PAAF1Q9BRP4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PAAF1Q9BRP4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PAAF1Q9BRP4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PAAF1Q9BRP4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PAAF1Q9BRP4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PAAF1Q9BRP4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PAAF1Q9BRP4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PAAF1Q9BRP4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PAAF1Q9BRP4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PAAF1Q9BRP4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PAAF1Q9BRP4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PAAF1Q9BRP4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PAAF1Q9BRP4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PAAF1Q9BRP4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PAAF1Q9BRP4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PAAF1Q9BRP4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PAAF1Q9BRP4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PAAF1Q9BRP4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PAAF1Q9BRP4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PAAF1Q9BRP4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PAAF1Q9BRP4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PAAF1Q9BRP4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PAAF1Q9BRP4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PAAF1Q9BRP4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PAAF1Q9BRP4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PAAF1Q9BRP4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PAAF1Q9BRP4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PAAF1Q9BRP4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAAF1Q9BRP4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAAF1Q9BRP4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAAF1Q9BRP4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAAF1Q9BRP4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAAF1Q9BRP4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAAF1Q9BRP4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAAF1Q9BRP4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAAF1Q9BRP4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAAF1Q9BRP4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PAAF1Q9BRP4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PAAF1Q9BRP4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAAF1Q9BRP4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAAF1Q9BRP4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAAF1Q9BRP4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAAF1Q9BRP4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAAF1Q9BRP4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAAF1Q9BRP4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PAAF1Q9BRP4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAAF1Q9BRP4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAAF1Q9BRP4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAAF1Q9BRP4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PAAF1Q9BRP4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PAAF1Q9BRP4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PAAF1Q9BRP4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PAAF1Q9BRP4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PAAF1Q9BRP4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PAAF1Q9BRP4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PAAF1Q9BRP4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PAAF1Q9BRP4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PAAF1Q9BRP4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PAAF1Q9BRP4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PAAF1Q9BRP4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAAF1Q9BRP4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAAF1Q9BRP4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAAF1Q9BRP4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAAF1Q9BRP4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAAF1Q9BRP4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAAF1Q9BRP4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAAF1Q9BRP4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAAF1Q9BRP4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAAF1Q9BRP4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAAF1Q9BRP4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAAF1Q9BRP4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAAF1Q9BRP4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAAF1Q9BRP4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAAF1Q9BRP4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAAF1Q9BRP4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAAF1Q9BRP4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAAF1Q9BRP4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAAF1Q9BRP4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAAF1Q9BRP4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAAF1Q9BRP4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAAF1Q9BRP4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAAF1Q9BRP4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAAF1Q9BRP4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAAF1Q9BRP4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAAF1Q9BRP4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAAF1Q9BRP4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAAF1Q9BRP4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAAF1Q9BRP4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAAF1Q9BRP4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms