Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP7

MGME1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGME1Q9BQP7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MGME1Q9BQP7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MGME1Q9BQP7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MGME1Q9BQP7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MGME1Q9BQP7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MGME1Q9BQP7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MGME1Q9BQP7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MGME1Q9BQP7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MGME1Q9BQP7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MGME1Q9BQP7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MGME1Q9BQP7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MGME1Q9BQP7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MGME1Q9BQP7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MGME1Q9BQP7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MGME1Q9BQP7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MGME1Q9BQP7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MGME1Q9BQP7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MGME1Q9BQP7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MGME1Q9BQP7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MGME1Q9BQP7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MGME1Q9BQP7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MGME1Q9BQP7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MGME1Q9BQP7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MGME1Q9BQP7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms