Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ70

TCF25, Transcription factor 25, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF25Q9BQ70 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TCF25Q9BQ70 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCF25Q9BQ70 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TCF25Q9BQ70 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCF25Q9BQ70 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCF25Q9BQ70 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCF25Q9BQ70 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCF25Q9BQ70 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCF25Q9BQ70 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCF25Q9BQ70 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCF25Q9BQ70 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCF25Q9BQ70 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCF25Q9BQ70 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCF25Q9BQ70 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCF25Q9BQ70 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCF25Q9BQ70 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCF25Q9BQ70 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCF25Q9BQ70 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCF25Q9BQ70 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCF25Q9BQ70 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCF25Q9BQ70 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCF25Q9BQ70 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCF25Q9BQ70 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TCF25Q9BQ70 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCF25Q9BQ70 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCF25Q9BQ70 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCF25Q9BQ70 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCF25Q9BQ70 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCF25Q9BQ70 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TCF25Q9BQ70 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCF25Q9BQ70 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCF25Q9BQ70 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCF25Q9BQ70 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCF25Q9BQ70 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCF25Q9BQ70 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCF25Q9BQ70 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TCF25Q9BQ70 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCF25Q9BQ70 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms